信仰应该是多神祗的，山川祖先都可以祭祀供奉。女娲伏羲是那时延续秦和楚关于巫的信仰保留下来的吧。

佛教是西汉的时候传入的，道教在汉朝也已经兴起了，只是到了魏晋时期才真正发展，进而广泛流传，在那之前百姓大多信仰一些神祗，后来那些神祗大多被归入了道教的范围，而主持这方面的人称为“巫”或“祝”在汉末张仲景的《伤寒论》中就有“降志屈节，钦望巫祝，告穷归天，束手受败”说的就是百姓生病不看医生而去找巫师，可见当时的问题还是很严重的。
皇天后土泛指天地间的神明，“中馈”一指家室，一指酒菜，不修中馈的意思应该是指不务正业，至于皇天后土庙是宋朝到现在的一个古迹，里面确实供奉了女娲和伏羲，但汉朝之前后土貌似指的是黄帝，夸父，共公三者其中之一，也可以指土神，代表了百姓对土地的信仰。
你提的那些文章能考证到皇天后土庙已经很不错了，我看的不少文章穿到秦朝或者战国甚至战国之前里面居然有佛寺，包括很有名的那什么《寻找前世之旅》都有这样的问题。但小说嘛，看看就过了，懒得去计较那么多了。也正因为考证困难，所以现在的穿越架空非常盛行，可以随便YY嘛

女娲和伏羲的传说新石器时代就开始传了, 大地湾遗址里有印证此传说的痕迹.

不修中馈的意思是不婚姻嫁娶。
一直到西汉，某些家庭还有长女不出嫁的习俗，《云梦秦简》记载楚地习俗是庚寅时间（年、月、日、时）出生的孩子，男不娶女不嫁，都要做巫。
楚地存在过巫娼习俗，或曰淫祀，在某些巫师祭祀场合男女混杂野合。汉承楚俗，董仲舒就记载过某些地方求雨，是让女巫与男子交合，一直到下雨为止。因为雨属阴。
《国语》中说，卫国的老百姓不干正事，道路两旁都是写巫者在跳舞。

不太清楚
不过应该有一些上古的神8～

祭姜太公庙

东王公,西王母...

姜太公是祖先神，中国人的祖先崇拜到现在还有影响

我们国家早期的原始宗教有自然神、祖先神、鬼魂、上帝等简单的介绍可见《中国文化概伦》——中国传统宗教信仰

 
东汉前,占仆巫师之类好象比较流行,大多皇帝也信这个
后来,占仆巫师衰败,就渐渐归到道教里去了

其实更始祖的时候是崇拜图腾的吧？

应该是山海经和庄子里的一些吧

西汉时候，汉武帝祭祀过主神东皇太一。扁鹊说过：“司命之所属，无奈何也。”司命应该就是当时的阎罗或死神。《九歌》里面还提到了云中君，湘夫人
皇天后土的出处在于：《尚书·武成》：“予小子其承厥志，底商之罪，告于皇天后土。”《左传·僖公十五年》：“君履后土而戴皇天。”
皇天后土庙又名坤柔圣母庙，原址在山西省吉县城东北的榭悉村，为省级重点保护文物，始建于宋天圣元年（1023年），现存建筑建于元代，年久失修已顷塌。1996年，在城南挂甲山上又依1:1之比例仿建了一座，面宽进深各3间，结构极为巧妙，整个建筑基本不用钉、铆等固定物，建造工艺为古之少有。
 
    庙内塑有伏羲、女娲巨像，下以制陶、渔猎等群塑铺之，再现往古先人之原始生活，庙下台阶建钟鼓楼各一，钟铸于金代天眷元年，重达千斤，发声清越洪亮，可达数十里之远。

祖宗啊，这个是最大的信仰
另外就是皇天后土了，不过天地只有皇帝才能祭祀，所以对普通人来说还是祖宗